1987年12月23日，日本各个出版社都收到了一封来自藤子工作室的通知函，在信中，两位藤子老师发表声明宣布藤子不二雄组合解散。这标志着这一对从小学就开始相识，并联手三十年多年的组合拆伙。
由于当时《哆啦A梦》的人气正如日中天，所以当这一消息经各大媒体正式对外宣布之后，整个日本漫画界为之哗然。
对于此次解散，两位藤子老师也都分别解释过缘由。
藤本弘说：“我们刚开始合作的时候，创作想法也都差不多。但是每个人的个性毕竟是不同的，在讨论的情节的时候，也很难达成一致。所以之后我们就各自创作各自的作品，也会在各自需要的时候，去帮对方忙。时间一长，也难免感到有所束缚。”
安孙子素雄说：“随着时间的推移，创作也好，生活也好，我们之间分化也越来越大。藤本君是个生活简单、工作严谨的人，他就是白天工作，然后回家，偶尔看看电影什么的。我平日里喜欢参加一些社交活动，喜欢跟朋友喝酒，打高尔夫，而这些藤本君都不太喜欢。这些年来，他（藤本弘）跟一开始的时候没什么两样，总是保持着童心。其实从Q太郎之后，我就开始画一些风格比较过激的作品了，而他（藤本弘）还在创作哆啦A梦这样的快乐漫画，所以我觉得这样会影响哆啦A梦在大家心里的位置。另外，我的创作热情也始终不及藤本君，我更多的想做一些漫画之外的事情。”
从两位老师的话中，不难看出，性格的不同，以及创作风格的不统一，应该是这对组合解散的主要原因。但是，二人在《小鬼Q太郎》之后，就已经很少共同创作了，虽然会为彼此的作品提供意见和创意，不过基本上还是各画各的。如果是真的觉得风格有差异，那为何过了二十多年才想到解散呢？而且，一位漫画家有着风格迥异的作品并不少见，手冢治虫的作品中就即有《铁臂阿童木》这样的少年漫画，又有《恐怖故事集》这样的惊悚题材，甚至还有宗教色彩浓厚的《佛陀》，风格形形色色、各种各样。而藤本弘本人也有哆啦A梦和SF短篇这样的风格相差很大的作品，更何况是二人组合了，所以创作风格不统一并非主要原因。
要分析二人组合解散背后的原因，就得先了解一个事实，那就是藤子不二雄这个组合的收入是如何分配的。
早在1951年，两人凭借四格漫画《天使之玉》出道的时候，藤本弘就建立了一个共同的储蓄账户来管理稿费，收入所得二人平分。对此，安孙子素雄就说：“我们无论谁画了多少，收入都五五份，所以这么多年来，我们从来没有因此产生过纠纷。”
1980年代开始，《哆啦A梦》开始成为日本国民漫画，相继推出动画和电影，其IP价值也水涨船高。因此在很多外人看来，安孙子素雄无疑是沾了藤本弘的光，所以就有人提出，因为收入分配而产生的心理不平衡，是两位老师要分开的原因。
但是这里也不能忽略一个事实：1974年，随着单行本的畅销，《哆啦A梦》的人气才开始上涨，而从《小鬼Q太郎》完结之后到1974年近十年的这段时间里，藤本弘可以说是处于一个低谷时期，所创作的作品都没有获得非常好的人气，尤其是1973年动画的失败，甚至差点就把《哆啦A梦》这部作品给毁了，反观安孙子素雄那时候的作品却比较受欢迎。可以说那时候，“藤子不二雄”这个名字，可能更多的是要依靠安孙子素雄扛着在漫画界前行，而他也在鼓励、支持着藤本弘，直到他创作出哆啦A梦而大获成功。所以说，在《创作《哆啦A梦》之前，藤本弘是沾了安孙子素雄的光，如果因为收入问题而有了不平衡的心理，那么安孙子素雄早就把藤本弘给甩了。所以以两位老师的友情和人品，也不会因为收入问题而闹到解散的地步。
两位老师对于平分收入抱着无所谓的态度，但是不代表两位老师的家人也这么看。
这里就不得不提到一个人，那就是松野喜多枝。
松野喜多枝是安孙子素雄的姐姐，两个人在离开了“零·工作室”之后，成立了藤子工作室，而松野喜多枝是在《哆啦A梦》连载期间成为了藤子工作室的社长，负责工作室管理以及对外联系等事务。
一位小学馆的编辑回忆说：“在松野喜多枝来到藤子工作室之前，在工作上的事，我们编辑都可以直接跟两位藤子老师商量。但是自从松野喜多枝接手工作室的经营之后，想要找两位老师，就必须要先通过松野喜多枝，她非常强势，出版社和工作室的人，都不敢违抗她。我不知道她这么做的目的是什么，也许是想把工作室的重心转移到自己的弟弟安孙子老师身上。但是她的这种做法，打破了工作室原有的平衡。有一次我去了藤子工作室，明显感觉到气氛和之前不一样了。藤本弘老师是个沉默寡言的人，而且为人宽厚，但是他的家人对此肯定会有很大意见。”
而曾担任过藤本弘助手的海佬原武司也说：“之前两位老师都是在一个办公室工作，可是后来，安孙子老师就搬到了一个独立的办公室，而藤本老师还是和我们这些助手一起，在一个大办公室里。我们基本上很少见到安孙子老师，只有杂志社或者电视台来采访的时候，他才会出现。”
所以松野喜多枝的这些做法在外人看来，就是因为松野喜多枝觉得《哆啦A梦》大受欢迎，长此以往，藤本弘将会在“藤子不二雄”占据主导地位，所以她不得不利用自己做为藤子工作室社长的权威，来打压藤本弘。
藤本弘于1987年7月因胃部手术而住进了医院，情况比较严重，当时包括《哆啦A梦》在内的作品都暂停了连载，多年之后流传的假结局的源头也正是来自于此。
据两位藤子老师的好友长谷邦夫回忆，当时住院的藤本弘曾一度感到自己大限将至，而之前发生的一系列事情，让他觉得如果两人其中之一身故，那么两家人很有可能因为利益分配问题而闹的不可开交。如果只是两个人的事情，凭借着多年深厚的情谊，一切都不是问题，但是现在，两个人已经有了各自的家庭，面对残酷的现实，也不得不做出决定。
据安孙子素雄的外甥女松野泉回忆，有一天，藤本弘来到了安孙子素雄的家里对安孙素子雄说：“我们不知道还能再画多长时间，不如我们就此分开，放开手脚，去画自己想画的作品吧。”
“藤子不二雄”这个组合的解散，看似残酷，但实际上却是两个人深厚情谊的体现。
两位老师从小学时代就相识，之后一同前往东京打拼，在最困难的时候没有放弃而是互相鼓励、互相扶持。这种深厚情谊也体现在两个人的创作上，不难发现，两个人的很多作品中，都有着双主角的设定：《小鬼Q太郎》中的Q太郎和阿正、《怪物君》中的怪物君和阿宏、《哆啦A梦》中的哆啦A梦和大雄……正如他们二人在一次访谈中所说：“我们是多年的至交，这些都自然而然的反应在了我们的作品里，希望我们以后也能两个人一直在一起，用漫画把这种友谊，快乐的描绘下去……”
但是，当这种合作开始面对来自外界因素影响的时候，尤其是这种影响还是来自彼此的家人，也许分开就是最好的选择。这种分开，与利益无关，与感情无关，而是充分的站在了对方的立场而做出的决定，因此这种“分开”虽然充满了惋惜，但是却体现了他们之间友谊的伟大……
所以虽然组合解散，但是并不意味着两位老师的友谊不存在了，藤本弘喜欢旅游，每到一个地方都会给安孙子素雄带一些当地的纪念品，而安孙子素雄也很喜欢，并且将这些纪念品摆放在自己的家和工作室里。另外，两个人也都喜欢电影，所以也会经常一起出席电影的首映活动。所以，在解散之后，两个人还在一起用“藤子不二雄”这个笔名，只是各自加以区别，安孙子素雄叫做藤子不二雄Ⓐ，藤本弘则叫藤子不二雄Ⓕ。这里的Ⓐ和Ⓕ各自取自两人姓氏的罗马字拼写的首字母。这也是向世人宣告，虽然我们不再合作了，但是我们依然还是“藤子不二雄”。
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