在单行本第28卷有个名为《忍者修行组合》的故事，故事中，哆啦A梦给了大雄一本《忍者服部君》（藤子不二雄Ⓐ著）的漫画，大雄看了漫画之后，对忍者产生了兴趣，哆啦A梦就给了他一套“忍者修行组合”的道具，大雄满怀信心的开始练习，却发现忍者的训练非常艰苦。
可以说，“忍者”已经成为日本最具有代表性的文化符号之一，各种与“忍者”题材有关的漫画、动画、游戏、影视剧数不胜数。也正是因为这些艺术作品，普通人对于忍者的印象大多都是“神秘、低调、神通广大”。
其实忍者远没有艺术作品中所描述的那么神秘，所谓的忍者，其主要任务就是完成一些诸如盗取情报、暗杀、破坏等见不得光的工作，其工作性质本质上与詹姆斯·邦德（电影《007》系列）、伊森·亨特（电影《碟中碟》系列）、杰森·伯恩（电影《碟影重重》系列）这些间谍或者特工没什么不同，也没有任何超能力或者法术，像《火影忍者》中的鸣人等人，与其说是忍者，还不如说是超级英雄更贴切。
忍者在日本的历史，最早可以追溯到飞鸟时代（公元592年-公元710年），在部分文献中便有类似间谍工作的记载。
“忍者”一词来源于汉语词汇“隐忍”，就是形容从事忍者工作的人都是见不得光的。这一名称其实也是在近代的文学作品中才被确定下来的。忍者一般都会使用“忍术”，在现代作品的演义下，这些忍术往往神通广大，忍者借助忍术，可以隐身、变成各种动物或者人、甚至还能飞行，但现实中，忍术只不过是忍者完成任务所要具备的技能，比如攀岩、稍声无息的快速移动、怎样借助地形以及建筑来隐藏自己等等。而忍者也都是使用像飞镖等便于携带和用于暗杀的武器为主。
而要完成忍者的工作，就需要从身体到精神上进行严酷的训练：包括日常体力、忍耐力、格斗技巧、生存技巧，为了能够完美的完成任务，甚至还要博览群书，学习天文、气象、地理等各种知识，在这种可以用“非人”来形容的训练下，忍者的成材率极低，而能够通过训练成为忍者的人，可以说都是身心能够达到人类极限、精通十八般武艺的精英。在漫画中，大雄所做的那些训练，只不过是真实忍者所经受的冰山一角而已。
从等级上来看，忍者一般分为上忍、中忍、和下忍。
上忍都是一个忍者组织的领导者，他们从雇主或者领主那里接到任务，并制定相应的计划。
而中忍一般就是执行实际任务的负责人。
下忍就是活跃在一线的任务执行人了，也就是干脏活和累活的。而同样是间谍特工，相对于有美女陪伴、开着豪车座驾的詹姆斯·邦德等人来说，这些下忍就显得比较悲催了：为了盗取情报，潜伏在一个地方不吃不喝是常有的事。那时也没有《日内瓦公约》，如果被抓了，受尽酷刑折磨之后，也就只有死路一条。所以忍者如果任务失败，为了避免被抓，基本都会选择自尽。
由于日本战国时代各大名之间的纷争不断，所以这个时期也是忍者最盛行的时代，很多大名都会培养自己的心腹忍者，而这一时期也是忍者传奇故事流传最多的时期，比如著名的德川家康和他亲信服部半藏正成。战国时期著名的侠盗——石川五右卫门相传也是织田信长麾下的忍者出身。非常有名的漫画《落第忍者乱太郎》以及其改编动画《忍者乱太郎》的故事背景就是在日本战国时期。
进入江户时期，随着日本的统一，忍者的活动虽然减少，但是也并不意味着消失，因为德川幕府为了方便控制其它诸侯，也会在日本各地安插忍者搜集情报。
忍者之所以让普通老百姓觉得如此神秘，其根本原因也是“忍者”这一“职业”本身。忍者多是从事见不得光的工作，所以对于派遣忍者的大名来说，自然是不会承认的。在统治阶级眼里，忍者和一次性消耗品无异：任务失败，只有死路一条，任务成功，也有可能为了避免泄漏机密而被灭口。这些在影视、动画里看起来风光无限的忍者，说到底也就是统治者实现自己目的的工具而已。所以史书也好，文献也好，对于忍者的记载也就非常之少了。在江户时期之后，各种民间故事或者文学，又对忍者或者忍术进行夸大，也让大众对于忍者神秘感和误解加深。比如在很多文艺作品中，忍者都是穿着纯黑色衣服，实际上，忍者大多数都是穿着深蓝色或者深紫色的衣服。而在江户时期，还有很多民间艺人利用戏法来表演所谓的“忍术”，这也是大众会认为忍术神通广大的原因之一。
到了近代，随着游戏、动漫等各种作品的演绎，忍者也就成了日本在全球范围内一个文化符号了。现如今，在甲贺、伊贺等日本古时忍者活跃的地方，还有忍者表演或者体验。
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